To Αρχαιολογικό Μουσείο Ηρακλείου συμμετέχει στην ετήσια επικοινωνιακή δράση του Υπουργείου Πολιτισμού και Αθλητισμού «Πράσινες Πολιτιστικές Διαδρομές» με τη διοργάνωση εκπαιδευτικών προγραμμάτων και θεματικής ξενάγησης.